Adobe Reader peut afficher des documents PDF intégrés dans les fenêtres de navigateur Web ou d'ouvrir tous les fichiers PDF dans une fenêtre de lecture en dehors du navigateur Web. Les utilisateurs peuvent modifier cette préférence à partir de la fenêtre Préférences de l'application Adobe Reader, mais les administrateurs système peuvent également définir cette préférence dans le Registre Windows. Le paramètre de Registre peut être peuplé de plusieurs machines sur un réseau, ce qui permet aux administrateurs système de définir la préférence sur un grand nombre d'ordinateurs sans ajuster la préférence dans l'application sur chacun d'eux.