L'émulateur Dolphin est un programme qui émule Nintendo GameCube et jeux Nintendo Wii. "The Legend of Zelda: The Windwaker" a été publié pour la Nintendo Gamecube si l'émulateur Dolphin est capable d'y jouer. L'émulateur Dolphin gère la plupart des jeux Nintendo GameCube et Wii de Nintendo, mais il ya certains jeux qui ont des problèmes graphiques ou des problèmes de performance. "The Legend of Zelda: The Windwaker" peut être modifié pour fonctionner plus efficacement dans l'émulateur Dolphin.