Le système de dépôt de Microsoft Windows vous accorde beaucoup de contrôle sur l'organisation des données. Vous pouvez ajouter un nombre presque infini de sous-dossiers dans un dossier racine donnée et compresser, cacher, les archives, ou créer des profils de sécurité personnalisées pour eux. Vous pouvez ajouter des sous-dossiers à l'aide de l'invite de commande, ou graphique de l'interface utilisateur de la fenêtre (GUI) - cependant, la création de dossiers via l'interface graphique est plus facile pour les utilisateurs peu familiers avec la syntaxe d'invite de commande.